logo
calendar28 Noyabr 2019
view40
Основной язык:Русский

Программный модуль визуализации промежуточных результатов молекулярного докинга

Область науки:
pdf

5ddfa1322138c.pdf

PDF

Hisoblash va amaliy matematika muammolari

Hisoblash va amaliy matematika muammolari

Опубликовать статьюsee more

АННОТАЦИЯ СТАТЬИ

quote
В настоящей статье предложен алгоритм, программный модуль и способ визуализации промежуточных результатов вычислительных экспериментов, в частности, молекулярного докинга на основе технологии портлетов, устанавливаемых на специализированные веб-интерфейсы доступа к распределенным вычислительным грид-системам. Предлагаемый программный модуль поможет исследователю качественно оценить корректность постановки вычислительного эксперимента на удаленных вычислительных ресурсах, вовремя внести поправки в исходные данные задания на расчет идущий в ложном направлении и своевременно перезапустить задачу. Что позволит рационально использовать процессорное время дорогостоящего серверного оборудования.

АВТОРЫ

V.Bruskov

Института химии растительных веществ АН РУз

D.Bazarov

Центра разработки программных продуктов и аппаратно-программных комплексов при Ташкентском университете информационных технологий

R.Bazarov

Центр разработки программных продуктов и аппаратно-программных комплексов при Ташкентском университете информационных технологий

Теги

# визуализация# visualization# грид-портал# jmol# молекулярный докинг# grid-portal# visualizatsiya# molekular doking# molecular docking

ДРУГИЕ СТАТЬИ ЭТОГО ЖУРНАЛА

Оценить статью

0
оценок: 0
5
4
3
2
1

Идентификаторы статьи

ROI:

https://eroi.uz/11.0007/A1119-0044

DOI:

Недоступно

Список литературы

Ладик Я. Квантовая биохимия для химиков и биологов. - Москва : Издательство «Мир», 1975.

AutoDock [Электронный ресурс] / The Scripps Research Institute. - Режим доступа: http://autodock.scripps.edu.

Trott O., Olson A.J. AutoDock Vina: improving the speed and accuracy of docking with a new scoring function, efficient optimization and multithreading // Journal of Computational Chemistry, 31 (2010), 455-461

Bruskov V., Bazarov R., Bazarov D. Development of the grid-infrastructure for molecular docking problems // Proceedings of NEC’2011. - Varna, Bulgaria, - Pp.64-68 (2011г)

Z. Farkas, P. Kacsuk, P-GRADE Portal: A generic workflow system to support user communities, Future Generation Computer Systems, - 2011 - Vol. 27, - Is. 5, - Pp. 454-465,

Java Specification Request 168 [Электронный ресурс] / Oracle Corporation. - Режим доступа: http://www.jcp.org/en/jsr/detail?id=168.

GridSphere [Электронный ресурс] / GitHub Inc. - Режим доступа: https://github.com/brandt/GridSphere

P-GRADE Grid Portal [Электронный ресурс] / Slashdot Media - Режим доступа: https://sourceforge.net/projects/pgportal/files/pgportal/pgportal-2.10.1

Angel Herráez. How to use Jmol to study and present molecular structures, - Vol.1. Lulu Enterprises: Morrisville, NC, USA ,2007, ISBN 978-1-84799-259-8.

Gutiérrez E., Costantini A., López Cacheiro J., Rodríguez, A. G-FLUXO: A workflow portal specialized in Computational BioChemistry. In: 1st Workshop IWPLS 2009 (2009), http://www.nesc.ac.uk/esi/events/1000/.

Свидетельство № DGU 03140. Программный продукт «Портлет визуализации промежуточных результатов молекулярного докинга на основе Jmol» / В.П. Брусков, Д.К. Базаров, Р.К. Базаров, Н.Д. Абдуллаев ; АИС Руз, Ташкент. Загеристр. 11052015г.