5de9eff849d93.pdf
DOI:
Mavjud emas
Levinthal C. How to Fold Graciously // Mossbauer Spectroscopy in Biological Systems: Proceedings of a meeting held at Allerton House, Monticello, Illinois. J.T.P. DeBrunner and E. Munck eds., University of Illinois Press. - № 41, 1969. - Рp. 22-24.
Mann, M., S. Will, and R. Backofen. CPSP-tools - Exact and complete algorithms for high-throughput 3D lattice protein studies.Bmc Bioinformatics. - № 9(1), 2008. - 230 p.
Thachuk, C., A. Shmygelska, and H.H. Hoos, A replica exchange Monte Carlo algorithm for protein folding in the HP model // Bmc Bioinformatics № 8, 2007. – 342 p.
Gordon S. The self-avoiding walk: a brief survey // Proceednigs of the 33rd SPA Conference. Surveys in Stochastic Processes. Berlin: European Math. Society, 2010. - Рp. 181–199.
Shmygelska, A. and H.H. Hoos. An ant colony optimisation algorithm for the 2D and 3D hydrophobic polar protein folding problem // Bmc Bioinformatics. - № 6(1), 2005. – Рp. 30.
Thalheim T., Merkle D., Middendorf M. Protein folding in the HP-model solved with a hybrid population based ACO Algorithm // IAENG International Journal of Computer Science. - № 35 (3), 2008. - Рp. 291-300.
Xiao-Min Hu, Jun Zhang, Yun Li. Orthogonal methods based ant colony search for solving continious optimization problems // Journal of Computer Science and Technology. - № 23(1), 2008. - Рp. 2-18 (JCST_paper.pdf).
Stuzle T., Doringo M. A short convergence proof for a class of ACO algorithms // IEEE Transactions on Evolutionary Computation. – № 6(4), 2002. - Рp. 358-365.
Carvelli L., Sebastiani G. Some issues of aco algorithm convergence / Ant Colony Optimization - Methods and Applications, (Ed. A.Ostfeld) - InTech, 2011. - Рp. 39-52.
Гуляницкий Л. Рудык В. Анализ алгоритмов прогнозирования третичной структуры протеина на базе метода оптимизации муравьиными колониями // Problems of Computer Intellectualization (Eds. V.Velichko, O.Voloshin, K.Markov). – Kiev-Sofia: V.M.Glushkov Institute of Cybernetics, ITHEA, 2012. – Рp. 152-159.
Chu D., Till M., Zomaya A. Parallel ant colony optimization for 3D protein structure prediction using the HP lattice model // Proceedings 19th IEEE International Parallel and Distributed Processing Symposium. - № 07, 2005. - 193 p.
Chu D., Till M., Zomaya A. Parallel ant colony optimization for 3D protein structure prediction using the HP lattice model // Proceedings 19th IEEE International Parallel and Distributed Processing Symposium. - № 07, 2005. - 193 p.
Delisle P., Krajecki M., Gravel M., Gagne C. Parallel implementation of an ant colony optimization metaheuristic with OpenMP// Proceedings of the 3rd European Workshop on OpenMP (EWOMP'01), Barselona, 2001. - Рp. 8- 12.
Wen-mei W. Hwu. GPU computing gems emerald edition. - Morgan Kaufmann Publishers Inc. San Francisco, CA, USA, 2011. – 886 p.
Бекмуратов Т.Ф., Мухамедиева Д.Т., Базаров Р., Ахмедов Д.Д. Параллельный муравьиный алгоритм оптимизации // Узб. журнал «Проблемы информатики и энергетики». – Ташкент, 2014. - № 1-2. - С. 11-15.
Базаров Р.К. Программный продукт: «Параллельная версия программы, реализующей муравьиный алгоритм сворачивания белоков на плоскости (АСО-HPPFP-2)» // АИС РУз. Свидетельство № DGU-02697. 26.12.2012 г.
Базаров Р.К. Программный продукт: «Реализация муравьиного алгоритма для изучения фолдинга белков на плоскости методами программных агентов (Agent-ACOHPPFP-2)» // АИС РУз. Свидетельство № DGU- 04104. 09.12.2016 г.
Базаров Р.К. Программный продукт: «Реализация муравьиного алгоритма для изучения фолдинга белков на плоскости с помощью графических процессоров (GPU-ACO-HPPFP-2)» // АИС РУз. Свидетельство № DGU-03215. 08.07.2015 г.
Базаров Р.К. Решение задачи фолдинга белков в распределенных вычислительных грид-системах // «Проблемы информационных и телекоммуникационных технологий»: Сб. докладов Републиканской научно-технической конференции. 10-11 марта 2016. - Ташкент, 2016. Ч.2. - С. 130-131.
CUDA Zone [Электронный ресурс] / NVIDIA Corporation. – Режим доступа: https://developer.nvidia.com/cuda-zone.