РАЗРАБОТК А СИСТЕМЫ АС-ПЦР ДЛЯ ВЫЯВЛЕНИЯ ПОЛИМОРФИЗМА RS4149056 В ГЕНЕ SLCO1B1, АССОЦИИРОВАННОГО С СЕРДЕЧНО -СОСУДИСТЫМИ ЗАБОЛЕВАНИЯМИ В УЗБЕКСКОЙ ПОПУЛЯЦИИ

Тадқиқотда SLCO 1B1 генидаги rs4149056 полиморфизмини аниқлаш учун тезкор ва иқтисодий
жиҳатдан самарали ПЗР тестини ишлаб чиқиш тасвирланган. Синовнинг самарадорлиги симвастатин
дори воситасини қабул қила олмайдиган 247 нафар бемор ва 34 нафар назорат гуруҳидагилардан аж-
ратилган ДНК намуналарида баҳоланди. Специфик праймерларни ишлаб чиқиш ва in silico ПЗР мо-
деллаштиришда биоинформатик дастурдан, шунингдек, генотипни идентификация қилиш ва АС-ПЗР
тестининг спецификлигини баҳолаш учун стандарт молекуляр генетик усуллардан фойдаланилган.
Натижада SLCO 1B1 генидаги 521Т> C полиморфизмини тезкор аниқлаш учун бир босқичли мульти-
плекс аллел- специфик ПЗР ишлаб чиқилди.
Полиморф генотиплар гель-электрофорезда 260, 179 ва 123 нж. да кўринади. CC генотипи узунлиги
260 ва 123 нж, ТТ – 260 нж.ни ташкил қилади ва 179 нж, CТ – 260, 179 ва 123 нж дан иборат. Ишлаб
чиқилган АС-ПЗР тестидан минимал даражада жиҳозланган диагностика ва тадқиқот лабораторияла-
рида фойдаланиш мумкин. Ушбу ёндашув юрак-қон томир касалликлари ва бошқа касалликлар би-
лан боғлиқ бошқа генлардаги SNP ларни аниқлаш учун мультиплексли АC-ПЗР тестларини ишлаб
чиқишда ҳам қўлланилиши мумкин.

The study describes development of rapid and economically efficient PCR test to identify rs4149056
polymorphism in SLCO 1B1 gene. The effectiveness of the test was evaluated on DNA samples isolated from
247 simvastatin intolerant patients and 34 controls. Bioinformatic software for designing of specific primers
and in silico PCR simulation and standard molecular genetic methods were used for genotype identification
and AS-PCR test specificity. As a result, a single tube multiplex allele specific PCR was developed for rapid
identification of 521T>C polymorphism in SLCO 1B1 gene. Polymorphic genotypes easily visualized as 260
bp, 179 bp, and 123 bp bands in gel electrophoresis. The СС genotype produce fragments of 260bp and
123 bp, ТТ – 260 bp and 179 bp, СТ – 260 bp, 179 bp, and 123 bp. The developed AS-PCR test is suitable
for use in minimally equipped diagnostic and research laboratories. This approach can also be used
to develop a multiplex AS-PCR tests for detecting SNPs in other genes associated with CVD and other
diseases.

В исследовании описывается разработка быстрого и экономически эффективного ПЦР-теста для
выявления полиморфизма rs4149056 в гене SLCO 1B1. Эффективность теста оценивалась на образ-
цах ДНК, выделенных у 247 пациентов с непереносимостью симвастатина и у 34 контрольных пациентов. Биоинформатическое программное обеспечение для разработки специфических праймеров и
моделирования ПЦР in silico, а также стандартные молекулярно-генетические методы использова-
лись для идентификации генотипа и оценки специфичности теста АС-ПЦР. В результате была раз-
работана одностадийная мультиплексная аллель-специфическая ПЦР для быстрой идентификации
полиморфизма 521 T > C в гене SLCO 1B1. Полиморфные генотипы легко визуализируются в виде по-
лос размером 260, 179 и 123 п.н. в гель-электрофорезе. Генотип СС образует фрагменты длиной
260 и 123 п.н., TT – 260 п.н. и 179 пн, CT – 260, 179 и 123 п.н. Разработанный тест AC-PCR подходит
для использования в минимально оснащенных диагностических и исследовательских лабораториях.
Этот подход также можно использовать для разработки мультиплексных тестов АС-ПЦР для обнару-
жения SNP в других генах, связанных с сердечно-сосудистыми и другими заболеваниями