Ushbu maqolada, Liriomyza sativae Blanchard zararkunda hasharot turi mitoxondrial sitoxrom c oksidaza I
(COI) geni asosida DNK-barkodlash yo‘li bilan molekulyar-genetik identifikatsiya qilinganligi to‘g‘risida ma’lumotlar keltirilgan.
Tahlil uchun namunalar O‘zbekistonning Toshkent va Buxoro viloyatlaridagi keltirilib, namunalardan mitoxondrial DNK
ekstraksiya qilingan. DNK namunalari asosida COI gen fragmenti esa HCO2198-L va LCO1490-L praymerlari yordamida
amplifikatsiya qilingan. Olingan izchilliklar, NCBI ma’lumotlar bazasida 100% o‘xshashlik bilan AQSh, Hindiston va Bangladeshdan
kiritilgan etalon L.sativae sekvenslari bilan mosligi aniqlangan va ushbu COI gen izchilliklari uchun GenBank kirish
raqamlari (PV123188, PV123187) olingan. Filogenetik tahlil natijasida har ikki mahalliy namuna jahon bo‘yicha tarqalgan
L.sativae sekvenslari bilan bir klasterda joylashib, L.trifolii, L.bryoniae, L.strigata, L.huidobrensis kabi yaqin turlardan aniq
farq qilgan. Ushbu tadqiqot L.sativae turining O‘zbekistonda molekulyar darajada ilk bor tasdiqlanishini va uning mintaqaviy
fitosanitar monitoringi hamda zararkunandalarga qarshi kurash tizimi uchun muhim genetik ma’lumotlar taqdim etadi.
Natijalar morfologik jihatdan o‘xshash yoki kriptik turlarni aniqlashda COI geni asosidagi DNK-barkodlashning ishonchli
va samarali ekanini tasdiqlaydi.
Ushbu maqolada, Liriomyza sativae Blanchard zararkunda hasharot turi mitoxondrial sitoxrom c oksidaza I
(COI) geni asosida DNK-barkodlash yo‘li bilan molekulyar-genetik identifikatsiya qilinganligi to‘g‘risida ma’lumotlar keltirilgan.
Tahlil uchun namunalar O‘zbekistonning Toshkent va Buxoro viloyatlaridagi keltirilib, namunalardan mitoxondrial DNK
ekstraksiya qilingan. DNK namunalari asosida COI gen fragmenti esa HCO2198-L va LCO1490-L praymerlari yordamida
amplifikatsiya qilingan. Olingan izchilliklar, NCBI ma’lumotlar bazasida 100% o‘xshashlik bilan AQSh, Hindiston va Bangladeshdan
kiritilgan etalon L.sativae sekvenslari bilan mosligi aniqlangan va ushbu COI gen izchilliklari uchun GenBank kirish
raqamlari (PV123188, PV123187) olingan. Filogenetik tahlil natijasida har ikki mahalliy namuna jahon bo‘yicha tarqalgan
L.sativae sekvenslari bilan bir klasterda joylashib, L.trifolii, L.bryoniae, L.strigata, L.huidobrensis kabi yaqin turlardan aniq
farq qilgan. Ushbu tadqiqot L.sativae turining O‘zbekistonda molekulyar darajada ilk bor tasdiqlanishini va uning mintaqaviy
fitosanitar monitoringi hamda zararkunandalarga qarshi kurash tizimi uchun muhim genetik ma’lumotlar taqdim etadi.
Natijalar morfologik jihatdan o‘xshash yoki kriptik turlarni aniqlashda COI geni asosidagi DNK-barkodlashning ishonchli
va samarali ekanini tasdiqlaydi.
This article presents information on the molecular-genetic identification of the insect-pest species Liriomyza sativae
Blanchard by DNA barcoding based on the mitochondrial cytochrome c oxidase I (COI) gene. For the analysis, samples were
collected from Tashkent and Bukhara regions of Uzbekistan, and mitochondrial DNA was extracted from the samples. Based
on the DNA samples, the COI gene fragment was amplified using the primers HCO2198-L and LCO1490-L. The obtained
sequences were found, in the NCBI database, to have 100% similarity with reference L.sativae sequences submitted from the
USA, India, and Bangladesh, and GenBank accession numbers (PV123188, PV123187) were obtained for these COI gene
sequences. As a result of phylogenetic analysis, both local samples clustered together with L. sativae sequences distributed
worldwide, and clearly differed from closely related species such as L. trifolii, L. bryoniae, L. strigata and L. huidobrensis.
This study represents the first molecular-level confirmation of L. sativae in Uzbekistan and provides important genetic data for
regional phytosanitary monitoring and pest control systems. The results confirm that DNA barcoding based on the COI gene
is a reliable and effective method for identifying morphologically similar or cryptic species.
В данной статье представлены результаты молекулярно-генетической идентификации насекомого
вредителя Liriomyza sativae Blanchard методом ДНК-баркодинг на основе митохондриального гена цитохром c
оксидазы I (COI). Для анализа образцы были отобраны в Ташкентской и Бухарской областях Узбекистана, из которых
выделяли митохондриальную ДНК. Фрагмент гена COI амплифицировали с использованием праймеров HCO2198-L и
LCO1490-L. Полученные нуклеотидные последовательности показали 100%-ное совпадение с эталонными секвенсами
L. sativae, представленными в базе данных NCBI из США, Индии и Бангладеш; для данных последовательностей
гена COI получены регистрационные номера GenBank (PV123188, PV123187). Филогенетический анализ показал,
что оба локальных изолята формируют общий кластер с секвенсами L. sativae, распространёнными по всему миру,
и отчётливо отличаются от близкородственных видов - L. trifolii, L. bryoniae, L. strigata и L. huidobrensis. Данное
исследование представляет собой первое молекулярное подтверждение L. sativae в Узбекистане и предоставляет
важные генетические данные для регионального фитосанитарного мониторинга и систем борьбы с вредителями.
Результаты подтверждают, что ДНК-баркодинг на основе гена COI является надёжным и эффективным методом
идентификации морфологически сходных или криптических видов.
| № | Author name | position | Name of organisation |
|---|---|---|---|
| 1 | Xo'jayev S.T. | yetakchi ilmiy xodim, q/x f.d, professor | O‘simliklar karantini va himoyasi ITI |
| 2 | Xakimov A.A. | dotsent, PhD | Toshkent davlat agrar universiteti |
| 3 | Xusenova N.N. | katta ilmiy xodim | O‘simliklar karantini va himoyasi ITI |
| № | Name of reference |
|---|---|
| 1 | 1. Злобин В.В., Другова Е.В. Минирующие мухи семейства Agromyzidae // Защита и карантин растений. – 2002. – №7. – С. 28-32. |
| 2 | 2. Информационная система ZInsecta. Зоологический институт РАН. https://www.zin.ru/projects/zinsecta/rus/zinsecta. asp [Электрон манба]. (мурожаат: 24.05.2025) |
| 3 | 3. Barcode of Life Data System (BOLD). http://www.boldsystems.org. Liriomyza sativae. [Elektron manba]. (murojaat: 2025 yil, 25 iyul) |
| 4 | 4. Boucher S., Savage J. DNA barcoding of the leaf-miner flies (Diptera, Agromyzidae) of Mitaraka, French Guiana // Zookeys. – 2022. – Vol. 1083. – P. 147–168. https://doi.org/10.3897/zookeys.1083.76651 |
| 5 | 5. Carapelli A., Soltani A., Leo C., Vitale M., Amri M., Mediouni-Ben Jemaa J. Cryptic diversity hidden within the leafminer genus Liriomyza (Diptera: Agromyzidae) // Genes. -2018. – Vol. 9(11). –P. 554. https://doi.org/10.3390/genes9110554 |
| 6 | 6. Ferreira E. C. B., Freitas M. T. de S., Sombra K. D. da S., Siqueira H. A. A. de, Araujo E. L. de, Balbino V. de Q. Molecular identification of Liriomyza sp. in the Northeast and Southeast regions of Brazil // Revista Caatinga. – 2017. – Vol. 30, no. 4. – Pp. 892–900. https://doi.org/10.1590/1983-21252017v30n409rc |
| 7 | 7. Hebert P.D., Ratnasingham S., deWaard J.R. Barcoding animal life: cytochrome c oxidase subunit 1 divergences among closely related species // Proceedings. Biological Sciences. – 2003. – Vol. 270, suppl. 1. – P. S96–S99. https:// doi.org/10.1098/rsbl.2003.0025 |
| 8 | 8. Hebert P.D.N., Cywinska A., Ball S.L., deWaard J.R. Biological identifications through DNA barcodes // Proceedings of the Royal Society of London. Series B: Biological Sciences. – 2003. – Vol. 270. – P. 313–321. https://doi.org/10.1098/ rspb.2002.2218 |
| 9 | 9. IPPC. DP 16: Diagnostic Protocol for Genus Liriomyza. Annex 16 to ISPM 27: Diagnostic Protocols for Regulated Pests [Elektron manba]. – Rome: International Plant Protection Convention, 2017. – Rejim dostupa: https://www.ippc.int/ static/media/files/publication/en/2017/01/DP_16_2016_En_2017-01-30.pdf (murojaat:.2025.07.08). |
| 10 | 10. Kosakyan A., Heger T.J., Leander B.S., Todorov M., Mitchell E.A., Lara E. COI barcoding of Nebelid testate amoebae (Amoebozoa: Arcellinida): extensive cryptic diversity and redefinition of the Hyalospheniidae Schultze // Protist. – 2012. – Vol. 163, No. 3. – P. 415–434. https://doi.org/10.1016/j.protis.2011.10.003 |
| 11 | 11. Lima Costa C.R., Freitas M.T. de S., Santiago Figueirêdo C.A., et al. Genetic structuring and fixed polymorphisms in the gene period among natural populations of Lutzomyia longi palpis in Brazil // Parasites & Vectors. – 2015. – Vol.8. – Article 193. https://doi.org/10.1186/s13071-015-0785-6 |
| 12 | 12. Maharjan R., Oh H.-W., Jung C. Morphological and genetic characteristics of Liriomyza huidobrensis (Blanchard) (Diptera: Agromyzidae) infesting potato crops in Korea // Journal of Asia-Pacific Entomology. – 2014. – Vol. 17. – P. 281–286. https://doi.org/10.1016/j.aspen.2014.01.013 |
| 13 | 13. National Center for Biotechnology Information (NCBI Database). Taxonomy ID: 127406. https://www.ncbi.nlm.nih. gov/ [Elektron manba]. (murojaat: 2025 yil, 25 iyul). |
| 14 | 14. Parrella, M.P. Biology of Liriomyza // Annual Review of Entomology. – 1987. – T. 32. – S. 201–224. https://doi. org/10.1146/annurev.en.32.010187.001221 |
| 15 | 15. Scheffer S.J., Wijesekara A., Visser D., Hallett R.H. Polymerase chain reaction–restriction fragment-length polymorphism method to distinguish Liriomyza huidobrensis from L. langei // Journal of Economic Entomology. – 2001. – Vol. 94. – P. 1177–1182. https://doi.org/10.1603/0022-0493-94.5.1177 |
| 16 | 16. Scheffer S.J., Winkler I.S., Wiegmann B.M. Phylogenetic relationships within the leaf-mining flies (Diptera: Agromyzidae) inferred from sequence data from multiple genes // Molecular Phylogenetics and Evolution. – 2007. – Vol. 42. – P. 756–775. https://doi.org/10.1016/j.ympev.2006.12.018 |
| 17 | 17. Spencer K.A. Host specialization in the world Agromyzidae (Diptera). – Dordrecht: Springer, 1990. – XII, 444 p. – (Series Entomologica; Vol. 45). https://doi.org/10.1007/978-94-009-1874-0 |