logo
calendar20 декабр 2019
view2
Asosiy til:Rus

Taqsimlangan tizimlarda agent dasturlash usulida oqsil foldingi uchun chumoli algoritmini tadbiq etish

Fan yo'nalishi:
pdf

5dfc62aa30571.pdf

PDF

MAQOLA ANNOTATSIYASI

quote
Dastlabki aminokislotali ketma-ketligi bo’yicha oqsil foldingining uchlamchi tuzilishini izlash strukturali bioligiya sohasining asosiy muammosi hisoblanadi. Afsuski, HP-PFP-2 tipdagi qo’pol modellar ham faqat ikki o’lchovli panjarada aminokislota qoldiqlarining gidrofobli ta’siri inobatga olingan, NP murakkab hisoblanadi va faqat evristik usulda global optimallashtirish orqali echimi olinadi. Masalan, chumoli algoritmi yordamida. Maqolada oqsil foldingi masalasi uchun chumoli algoritmini parallel hisoblash va takomillashtirish usullari tadqiq etilgan. Grid tizimi Jade platformasida chumoli algoritmini parallelashtirish dasturiy tatbiqi to’liq tavsiflangan. Hisoblash tajribalardan olingan natijalari muhokama etilgan.

MUALIFLAR

Teglar

# фолдинг белков# the ant colony optimization algo# protein folding problem# oqsil foldingi# chumolilar koloniyasini optimall# агентские системы# agent systems# agent tizimlari

Maqolani baholang

0

0 ta

Maqola idintifikatorlari

Foydalanilgan adabiyotlar

Boese, Joos-Hendrik; Feuerstack, Sebastian. Adaptive User Interfaces for Ubiquitous Access To Agent-based Services; In: Workshop on Human- Agent Interaction, Agentcities ID3; Barcelona, Spain, 2003.

DillK.A. Theory for the folding and stability of globular Proteins / Biochemistry № 24. - 1985. - Pр. 1501-1509.

Crescenzi P., Goldman D., Papadimitriou C., Piccolboni A., M. Yannakakis. On the complexity of protein folding. J Comp Bio, 5, 1998.

Shmygelska A. and H.H. Hoos. An ant colony optimisation algorithm for the 2D and 3D hydrophobic polar protein folding problem // Bmc Bioinformatics. - 2005. - № 6(1). - 30 p.

A.S. Kolaskar and Sangeeta Sawant, Prediction of conformational states of amino acids using Ramachandran plot / International Journal of Peptide and Protein Research. 1996. - № 47. - Pр. 110-116.

C. Levinthal. How to fold graciously // Mössbaun Spectroscopy in Biological Systems Proceedings. Univ. of Illinois Bulletin. Vol.67. -1969. - № 41. - Pр. 22-24

Финкельштейн А.В., Птицын О.Б. Физика белка: Курс лекций с цветными и стереоскопическими иллюстрациями и задачами. - М.: КДУ, 2012. - 456 с.

Макеев А.В. Основы биологии. - М.: Мир, 1997. - 235 с.

Малышенко А.М. Математические основы теории систем: учебник для вузов. – Томск: Изд-во Томского политехнического университета, 2008. – 364 с.

Alberts B., Johnson A., Lewis J. Molecular Biology of the Cell. New York Garland Science, 2002. – Режим доступа: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK26830

Istrail S, Lam F. Combinatorial algorithms for protein folding in lattice models: a survey of mathematical results. Commun. Inf. Syst., 2009. - № 9(4). - Pр. 303–346.

Richards F.M. Areas, volumes, packing and protein structure / Annual Review of Biophysics and Bioengineering. - 1977. - Vol.6, № 1. - Pр. 151-176.

Dill К.А. Dominant forces in protein folding. Biochemistry, 29:7133-7155, 1990.

Таненбаум Э., М. ван Стеен. Распределенные системы. Принципы и парадигмы. – СПб.: Питер, 2003. – 877с. (Серия «Классика computer science»).

Бекмуратов Т.Ф., Мухамедиева Д.Т., Базаров Р., Ахмедов Д.Д. Параллельный муравьиный алгоритм оптимизации // Узб. журнал «Проблемы информатики и энергетики». – Ташкент, 2014. - № 1-2. - С.11-15.

Базаров Р.К. Реализация муравьиного алгоритма фолдинга белков на графических процессорах // Проблемы вычислительной и прикладной математики. - Ташкент, 2017. - № 1. - C. 86-91.

Карпенко A.П. Параллельные популяционные алгоритмы одно- и многоцелевой оптимизации. Режим доступа: http://agora.guru.ru/abrau2014/pdf/240.pdf

Bellifemine, Fabio; Poggi, Agostino; Rimassa, Giovanni. JADE: A FIPA-compliant Agent Framework ; In: Proceedings of PAAM’99, London, April 1999. - Pр. 97-108.

Cao, J.; Kerbyson, D.J.; Nudd, G.R. Performance Evaluation of an Agent-Based Resource Management Infrastructure for Grid Computing. // Proceedings of 1st IEEE/ACM International Symposium on Cluster Computing and the Grid. -Brisbane, Australia, May 15-18 2001.- Pр. 311-318.

Senobari M., Drozdowicz M. , Paprzycki M., Kuranowski W., Ganzha M., Olejnik R., Lirkov I. Combining an JADE-agent-based Grid infrastructure with the Globus middleware—Initial Solution. // Proceedings of the CIMCA-IAWITC 2008 Conference, IEEE CS Press, Los Alamitos, CA, 2008. - Pр. 890-895.

Aversa R., Martino B., Rak M., Venticinque S. Cloud agency: A mobile agent based cloud system // Proc. Int Conf. Complex, Intelligent and Software Intensive Systems, 2010. - Pр. 132-137.

Cicirelli, F, Furfaro, A, Nigro, L, Pupo, F. Agents Over The Grid: An Experience Using The Globus Toolkit 4. // Proceedings of the 26th European Conference on Modelling and Simulation (ECMS'2012), 2012. - Pр. 78-85.

Corradini F., Merelli E. Hermes: agent-based middleware for mobile computing. / Lecture Notes in Computer Science, Vol 3465. Springer-Verlag, Berlin/Heidelberg, 2005. - Pр. 234-270.

S. Ilie and C, Badica, "Effectiveness of Solving Traveling Salesman Problem Using Ant Colony Optimization on Distributed Multi-Agent Middleware," // Proceedings of international Multiconference on Computer Science and Information Technology (IMCSIT), 2010. - Vol.5. - Рp.197-203.

González P.P.G., Beltrén H.I., Rojo-Domínguez A., Eduardo M., Gutiérrez S. Multi-Agent Systems Applied in the Modeling and Simulation of Biological Problems: A Case Study in Protein Folding. / World Academy of Science, Engineering & Technology. Issue 34. - 2009. - Pр. 128-137.

Cao, J.; Spooner, D.P.; Jarvis, S.A.; Nudd, G.R. Grid Load Balancing Using Intelligent Agents // Future Generation Computer Systems special issue on Intelligent Grid Environments: Principles and Applications. 21:1. 2005. - Pр. 135-149.

Cao J., Spooner D.P., Turner J.D., Jarvis S.A., Kerbyson D.J., Saini S., Nudd G.R. Agent-based Resource Management for Grid Computing // 2nd IEEE International Symposium on Cluster Computing and the Grid. - Berlin, Germany, May, 2002. - 350 р.

Adilova F.T., Ibragimov R.Sh., Bazarov R.K. Agent-based modeling and simulation: application in telemedicine // ICEIC-2008. Proceedings of 9th International Conference on Electronics, Information and Communication. - Tashkent, June 24-27 2008. - PS2-17. 2008. - P. 31.

Magda: A mobile Agent based Grid Infrastructure [Электронный ресурс ] / University of Neaples. Italy. - Режим доступа: http://parsec.unina2.it/~magda.

Bellifemine F., Poggi A., Rimassa G. JADE: A FIPA-compliant Agent Framework // Proceedings of PAAM’99, London, April 1999. - Pр. 97-108.

Globus Toolkit 4.0.7 Download [Электронный ресурс] / University of Chicago. - Режим доступа: http://toolkit.globus.org/toolkit/downloads/4.0.7

Bellifemine F., Caire G., Greenwood D. Developing Multi-Agent Systems with JADE. Willey, 2007. - 286 p.

Базаров Р.К. Реализация муравьиного алгоритма для изучения фолдинга белков на плоскости методами программных агентов (Agent-ACOHPPFP-2) // Агентство по интеллектуальной собственности РУз. Свидетельство № DGU-04104. 09.12.2016 г.

public

SLIB.uz — O'zbekiston ilmiy jurnallari va maqolalar yagona tizimda ilmiy nashirlarni bir joyda ko'rish, izlash va ulardan foydalanish imkonini beruvchi zamonaviy platforma.

Ijtimoiy tarmoqlarda
instagramtelegramyoutubefacebook

Bog'lanish uchun

Manzil:Chilonzor tumani Qatortol ko'chasi 60B

Tel:+998(55)511-44-00

Savol-javob va takliflar uchun

© 2026 Barcha huquqlar himoyalangan.